La PCR haute-fidélité est fréquemment utilisée pour le clonage et la mutagenèse. Cependant, les Taq polymérases standard ne peuvent pas être utilisée car elles font trop d'erreurs pendant l'amplification.

Les ADN polymérases haute-fidélité sont importantes pour les applications pour lesquelles la séquence d'ADN doit être correcte après l'amplification. La fidélité de l'ADN polymérase réfère à sa capacité à insérer la bonne base au bon endroit pendant la réaction de PCR. Communément, le taux de mauvaises insertions de nucléotides est connu sous le nom de taux d'erreurs de l'ADN polymérase. La PCR haute-fidélité nécessite une ADN polymérase avec un faible taux d'erreurs et permet un degré élevé de précision dans la replication de l'ADN d'intérêt.

On distingue différents types d'ADN polymérases haute-fidélité dont la Pfu polymérase, une ADN polymérase naturellement fidèle grâce à son activité exonucléase 3'-5' ainsi que des ADN polymérases modifiées pour obtenir des capacités de fidélité supérieures.

Les modifications apportés aux ADN polymérases pour leur apporter une fidélité supérieure sont de différentes natures : modification génétique, modification chimique, mélange de plusieurs enzymes ...

Nom	Taq Plus DNA polymerase	TransTaq DNA polymerase HiFi	Phanta Max Super-Fidelity DNA polymerase
Référence	NB-03-0097 and NB-03-0099	AP131	P505
Type	Mélange d'une Taq polymérase et d'une Pfu polymérase	Mélange d'une Taq polymérase et d'une exonucléase de relecture 3'-5'	Pfu polymérase modifiée
Vitesse	3 kb/min	1-2 kb/min	1-2 kb / min
Taille de l'amplicon	< 20 kb	< 15 kb	< 20 kb
Taux d'erreurs	7.5x10-5 erreurs / nt	3.6x10-6 erreurs / nt	4.1x10-6 erreurs / nt
Activité exonucléase 3'-5'	Oui	Oui	Oui