Le virus HPV16 est l'un des 120 sous-types de virus du papillome humain (VPH ou HPV pour Human Papilloma Virus) identifiés, environ 40 de ces sous-types infectant la muqueuse épithéliale du tractus anogénital, de la bouche et de la gorge. Dans la majorité des cas, l'infection par le VPH est asymptomatique et résolue de manière endogène, sans nécessiter d'intervention médicale. Cependant, l'infection par l'un des 14 types «à haut risque», y compris HPV16, introduit le risque de cancer du col utérin. Les anticorps anti-HPV16 peuvent être utilisés comme un outil de dépistage d'infection par HPV16 et pour surveiller si l'infection présente un risque de devenir cancéreuse.

La protéine L1 est une protéine de capside majeure du VPH de type 16. Les VPH 6 et 11 ont été associés à des maladies relativement bénignes telles que les verrues génitales, mais les types 16 et 18 sont fortement associés aux tumeurs malignes cervicales, vaginales et vulvaires.