Les billes de compensation sont des composants essentiels de la cytométrie en flux. Comme la cytométrie en flux évolue pour s'adapter à des expériences de plus en plus complexes impliquant plusieurs marqueurs fluorescents, la nécessité d'une compensation précise du chevauchement spectral devient primordiale. 

En cytométrie en flux, plusieurs colorants fluorescents sont souvent utilisés simultanément pour marquer différents marqueurs cellulaires. Cependant, de nombreux fluorophores ont des spectres d'émission qui se chevauchent, ce qui peut entraîner un débordement de la fluorescence. Ce phénomène se produit lorsque le signal d'un fluorochrome contamine le signal d'un autre, ce qui entraîne une interprétation inexacte des données. 

Les billes de compensation sont des particules spécialement conçues pour aider les chercheurs à calibrer leurs cytomètres de flux afin de corriger ce chevauchement spectral. Généralement fabriquées en polystyrène et recouvertes d'anticorps spécifiques à certains marqueurs, ces billes peuvent être marquées avec différents fluorochromes. Lorsqu'elles sont mélangées à des anticorps conjugués à des fluorochromes de manière contrôlée, elles créent des populations distinctes qui imitent le comportement des cellules réelles. En analysant des échantillons de billes de compensation en même temps que des échantillons expérimentaux, les chercheurs peuvent déterminer le degré de débordement entre les différents canaux. Cela permet d'ajuster précisément les réglages de l'instrument afin de s'assurer que chaque signal fluorescent est attribué avec précision au marqueur correspondant.