Réactifs et instruments pour l'immunologie, la biologie cellulaire et la biologie moléculaire.

Master Mix pour la quantification de banques Illumina®

La quantification précise du nombre de molécules d'une banque est l'étape la plus critique parmi les étapes de préparation pour le séquençage nouvelle génération (NGS) pour obtenir des données de lecture de haute qualité. En effet, pour obtenir des données de lecture fiables et de qualité, il est nécessaire d'utiliser une quantité suffisante d'ADN, et en particulier pour le séquençage Illumina®. L'utilisation d'une quantité insuffisante d'ADN entraînera un rendement de séquençage faible et la surabondance d'ADN augmentera la densité du cluster et aboutira à des données de mauvaise qualité.

La PCR quantitative est considérée comme la méthode la plus précise et efficace de quantification de banque.

Les master mix pour la quantification de banques pour le séquençage Illumina® contiennent les composants suivants :

ADN polymérase
dNTPs
MgCl2
du SYBR green ou EvaGreen
Des amorces permettant d'amplifier uniquement les molécules qui contiennent les deux séquences d'adaptateurs
Une solution de ROX à ajouter en fonction de l'appareil utilisé. Si la solution de ROX est séparée du mix, il s'agit d'un kit universel pouvant être utilisé avec tous les appareils. Si elle est contenu dans la mix, il est nécessaire d'utiliser le kit correspondant à l'appareil utilisé.

Universel	Tous les appareils
Sans ROX	Bio-Rad CFX96, CFX384, iCycler iQ, iQ5, MyiQ, MiniOpticon, Opticon®, Opticon 2, Chromo4; Cepheid SmartCycler®; Eppendorf Mastercycler® ep realplex, realplex 2 s; Illumina Eco qPCR; Qiagen/Corbett Rotor-Gene® Q, Rotor-Gene® 3000, Rotor-Gene® 6000; Roche Applied Science LightCyclerTM 480; Thermo Scientific PikoReal Cycler.
Low ROX	Applied Biosystems 7500, 7500 Fast, ViiA7; Stratagene MX4000, MX3005P, MX3000P
High ROX	Applied Biosystems 5700, 7000, 7300, 7700, 7900, 7900HT, 7900HT Fast; StepOne, StepOnePlus