La PCR (Polymerase chain reaction) est utilisée de façon courante pour l'amplification de fragments d'ADN lorsque qu'il de produits de tailles standard, en dessous de 1000 paires de bases. Les produits plus longs peuvent être synthétisés à des niveaux beaucoup plus faibles et généralement après de nombreux efforts d'optimisation de la réaction. La taille maximale d'amplification par PCR est limitée par la faible fidélité de la Taq polymerase (issue de Thermus aquaticus), la polymérase thermostable la plus utilisée. Cette limitation est due à la nature à risque d'erreurs de la Taq polymérase, par laquelle les transcrits qui se terminent par une erreur (une base mal incorporée) ne sont pas réinitialisés et étendus efficacement.

La PCR pour longs fragments (Long range PCR) permet l'amplification de produits PCR plus longs que ceux amplifiés par les Taq polymérases conventionnelles. Il est possible d'amplifier des fragments de plus de 20 kb avec un ADN génomique de bonne qualité. L'amplification de longs fragments d'ADN est nécessaire pour un certains nombres d'applications comme le séquençage et le clonage.