Le jéjunum fait partie du système digestif, il constitue la partie centrale de l’intestin grêle. Les deux autres parties de l’intestin grêle étant le duodénum et l’iléon. Le jéjunum est donc situé entre le duodénum en aval et l’iléon en amont. L’iléon et le jéjunum constituent la majeure partie de l’intestin grêle et la partie mobile de l’intestin grêle. Le jéjunum mesure environ 2 mètres de long pour un diamètre de 2 à 4 centimètres. Il est vascularisé par l'artère mésentérique supérieure et les muscles lisses sont contrôlés par le système nerveux autonome. Le pH est d'environ 7 à 8.

La paroi interne du jéjunum est constituée d'une muqueuse tapissée de nombreux replis, qui permettent une meilleure absorption des lipides, des glucides et des protides grâce à l'augmentation de la surface totale interne. Il est formé ensuite d'une musculeuse dont les fibres internes sont circulaires et les fibres externes longitudinales.