Les anticorps conjugués à la streptavidine sont devenus un outil essentiel dans la recherche sur les zebrafish en raison de leur affinité incomparable pour la biotine et de leur capacité à amplifier les signaux de détection dans divers contextes expérimentaux.

Applications uniques dans la recherche sur les zebrafish

• Surmonter les défis d'accessibilité des anticorps: Les conjugués à la streptavidine ont montré une supériorité par rapport aux anticorps traditionnels pour détecter les protéines dans des compartiments cellulaires séparés par phase, comme les pores nucléaires et les granules de stress. Une étude utilisant la biotinylation TurboID a révélé que la streptavidine pouvait étiqueter avec succès des protéines localisées dans des environnements denses et biophysiquement distincts où les anticorps conventionnels échouaient. Ce succès est attribué à la taille compacte de la streptavidine (60 kDa) par rapport aux anticorps IgG (150 kDa) et à son interaction beaucoup plus forte avec la biotine (~100 fois plus forte que les interactions typiques anticorps-antigène).
• Amplification du signal dans des conditions de faible antigène : Les conjugués à la streptavidine excellent dans les scénarios où la densité d'antigène est faible, tels que la microscopie d'expansion ou la microscopie corrélative lumière-électronique (CLEM). Les multiples sites de biotinylation introduits par TurboID augmentent l'intensité du signal, permettant une détection robuste même dans des conditions où les anticorps produisent des signaux faibles ou non spécifiques. Par exemple, l'imagerie avec la streptavidine a produit un signal de fluorescence 2,9 fois plus élevé par rapport aux anticorps anti-HA lors de l'analyse de protéines de faible abondance dans les pores nucléaires.
• Systèmes de biotinylation spécifiques aux tissus : Chez les zebrafish, les systèmes de biotinylation codés génétiquement tels que la « biotagging » ont permis de marquer spécifiquement des protéines dans des tissus. En combinant ces systèmes avec des anticorps conjugués à la streptavidine, les chercheurs ont réalisé un profilage précis des interactions protéiques et des schémas d'expression génique dans des populations cellulaires spécifiques. Cette approche a été particulièrement utile pour étudier les facteurs de transcription et la dynamique de la chromatine chez les embryons de zebrafish.

Les anticorps primaires anti-zebrafish conjugués à la streptavidine offrent des avantages inégalés en termes d'amplification du signal et d'accessibilité aux environnements cellulaires difficiles. Les avancées récentes dans l'étiquetage de proximité et la biotinylation spécifique aux tissus ont étendu leur utilité dans la recherche sur les zebrafish, offrant de nouvelles perspectives sur la localisation des protéines et les dynamiques des interactions. Les innovations futures visant à surmonter les limitations actuelles renforceront encore leur rôle d'outils indispensables pour l'étude de la biologie des zebrafish.