Myogenin gehört zu einer Familie von myogenen Transkriptionsfaktoren, zu denen auch MyoD, myf5 und MRF4 gehören, die für die Muskelentwicklung von entscheidender Bedeutung sind. Myogenische Faktoren sind Transkriptionsfaktoren, die aus einer aminosäurereichen Region und einer Helix-Loop-Helix-Struktur (HLH) bestehen, die Muskelentwicklung fördern und die muskelspezifische Genexpression durch Transaktivierung aufrechterhalten können. Myogenin spielt eine Schlüsselrolle bei der Entwicklung und Differenzierung von primitiven mesenchymalen Zellen zu Skelettmuskeln. Myogenin kommt ausschließlich in Zellen des Skelettmuskels vor und wird daher als Biomarker für Tumore der Muskellinie, einschließlich alveolärer Rhabdomyosarkome, verwendet. Eine Anti-Myogenin-Färbung kann bei Wilms-Tumoren auftreten und markiert die Kerne von Myoblasten in sich entwickelndem Muskelgewebe. Es wird auch in einigen Leiomyosarkomen exprimiert.