Die Autophagie ist ein wichtiger zellulärer Prozess, der den Abbau und die Verdauung intrazellulärer Komponenten durch das Lysosom beinhaltet. Dieser Prozess ermöglicht es den Zellen nicht nur, Zellbestandteile effektiv zu mobilisieren und zu recyceln, sondern verhindert auch die Ansammlung von beschädigten Organellen, falsch gefalteten Proteinen und eindringenden Mikroorganismen. Die Autophagie ist ein mehrstufiger Prozess, der mit der Sequestrierung von Organellen und zytoplasmatischen Proteinen beginnt. Diese zellulären Bestandteile werden von einer Doppelmembran umschlossen und bilden ein Autophagosom.
Die Beziehung zwischen Autophagie und Apoptose ist komplex. Beide Wege haben gemeinsame Stimuli und Komponenten und können die Aktivität des jeweils anderen Weges regulieren. Die spezifischen Faktoren und Mechanismen, die für die Entscheidung zwischen Autophagie und Apoptose ausschlaggebend sind, bleiben jedoch unklar.
Zur Messung von Autophagie und Zytotoxizität können Kits mit Monodansylcadaverin (MDC), einer fluoreszierenden Verbindung, die sowohl durch einen Ioneneinfangmechanismus als auch durch die Wechselwirkung mit Membranlipiden in multilamellare Körper eingebaut wird, als Sonde zum Nachweis von autophagischen Vakuolen in kultivierten Zellen verwendet werden. Propidiumjodid wird als Marker für den Zelltod verwendet.