SNPXplex: Identity Verification Kit for High-Throughput Sequencing

Die Empfehlungen für die gute Praxis bei der Hochdurchsatz-Sequenzierung stimmen darin überein, dass eine Technik zur Identitätsüberprüfung erforderlich ist, die auf dem Vergleich der Genotypen mehrerer Polymorphismen beruht, wobei die Genotypen unabhängig voneinander durch Hochdurchsatz-Sequenzierung (Next Generation Sequencing, NGS) und durch eine zweite Technik gewonnen werden. Der SNPXplex ist ein Identitätsnachweis-Kit, das die gleichzeitige Genotypisierung von 15 Einzelnukleotid-Polymorphismen (SNPs) durch allelspezifische fluoreszierende Multiplex-PCR und Geschlechtsbestimmung ermöglicht.

Seit 2017 im Einsatz, wurden bereits mehr als 70.000 NGS-Sequenzierungsergebnisse gesichert. Eine von der Assistance Publique - Hôpitaux de Paris (APHP) patentierte Technologie, die auf dem Vergleich von Genotypisierungsergebnissen (NGS vs. SNPXplex®) für mehrere Polymorphismen basiert.

Hauptmerkmale:

Einfaches, schnelles Protokoll

• Einziges, gebrauchsfertiges Reagenz
• Gleichzeitige Genotypisierung von 15 Einzelnukleotid-Polymorphismen (SNPs) durch allelspezifische fluoreszierende Multiplex-PCR + Bestimmung des Geschlechts ⇒Profils
• Risiko, zwei Patienten mit demselben Profil in einer Serie von 96 Proben zu haben:
  • <5% für alle Herkünfte zusammen 
  • <0,2% bei europäischer Herkunft

Kann verwendet werden mit:

• Zielgerichtete Panels, Exome und Genome
• Capture und Amplikon

Erforderliche Geräte :

• Thermocycler
• Kapillarsequenzierer (6-FAM™-Detektion)

Inhalt 

• Reagenz : SNPXplex 
• Volumen: 1200 µl

Lagerung: 

• Die Reagenzien können bei -20°C gelagert werden. Die Reagenzien können bei Raumtemperatur bis zu 8 Tage lang lichtgeschützt aufbewahrt werden.

Vergleich der SNPXplex- mit den NGS-Genotypisierungsergebnissen und der Genoidentitätsprüfung

SNPXplex-Genotypisierungsdaten können über die GeneMapper™-Exportfunktion exportiert werden.

Verwenden Sie lokale Ressourcen, um:

• Vergleichen Sie die SNPXplex-Genotypisierungsergebnisse mit den Ergebnissen der Hochdurchsatzsequenzierung auf der Basis einzelner Patienten.
• Durchsuchen Sie alle Patienten in der Serie auf mögliche Genidentität zwischen zwei Patienten.

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