Cytokeratin 5 (58 kDa) ist ein Zytokeratin vom Basistyp mit hohem Molekulargewicht, das in basalen, intermediären und oberflächlichen Zellschichten geschichteter Epithelien sowie in Übergangsepithelien, komplexen Epithelien und in Mesothelzellen und Mesotheliomen vorkommt. Zytokeratin 6 (56 kDa) ist ebenfalls ein Zytokeratin mit hohem Molekulargewicht vom Basistyp, das von proliferierendem Plattenepithel exprimiert wird, oft in Verbindung mit Zytokeratin 16.

Es hat sich gezeigt, dass CK5/6 bei der großen Mehrheit der Plattenepithelkarzinome, Basalzellkarzinome, Thymome, Speicheldrüsentumore und Mesotheliome exprimiert wird. Er reagiert selten mit Lungenadenokarzinomen. Anti-Cytokeratin 5 & 6 ist ein nützlicher immunhistochemischer Marker für die Identifizierung von Mesotheliomen und Plattenepithelkarzinomen der Lunge. Der Nachweis von Zytokeratin 5 in myoepithelialen Zellen kann auch bei der Bestimmung von Brust- und Prostatakarzinomen helfen.