NKX3.1 ist ein prostataspezifisches Tumorsuppressor-Homeodomain-Protein, das vom NKX3.1-Homeobox-Gen auf Chromosom 8p21 codiert wird. Dieses Protein ist haploinsuffizient und wird in frühen Stadien der Karzinogenese in prämalignen Läsionen und prostatischen intraepithelialen Neoplasien häufig herunterreguliert. Ein Verlust der Heterozygotie liegt bei 60-80 % der Prostatatumoren vor.

NKX3.1 wird im normalen Prostataepithel exprimiert und ist vorwiegend im Zellkern lokalisiert. Primäre und metastatische Adenokarzinome der Prostata weisen im Vergleich zur normalen Prostata eine geringere Färbeintensität auf. Es hat sich als hochempfindlicher und spezifischer Gewebemarker für prostatische Adenokarzinome erwiesen.

In der Differentialdiagnose ist NKX3.1 nützlich für die Unterscheidung zwischen Prostata- und Urothelkarzinom, wobei die Sensitivität zwischen 92-94 % und die Spezifität 100 % beträgt. In einer kürzlich durchgeführten Studie wurde auch die Nützlichkeit von NKX3.1 bei der Identifizierung von metastasiertem Prostata-Adenokarzinom nachgewiesen (98 % Sensitivität, 99 % Spezifität). Kombiniert in einem Panel mit PSA und PSAP waren alle metastasierten Prostata-Adenokarzinome für mindestens einen Marker positiv.