Perforin ist ein porenbildendes Protein mit einem Mechanismus zur Bildung von Transmembrankanälen, der dem von C9 ähnelt, und es wurde eine Homologie zwischen Perforin und C9 nachgewiesen. Perforin kommt in den Granula zytotoxischer T-Lymphozyten und natürlicher Killerzellen vor und hat die Aufgabe, das Eindringen von Granzymen in die Zielzellen zu ermöglichen und die Apoptose zu aktivieren. Die Expression von Perforin wird in aktivierten CD8+ T-Zellen hochreguliert, und es wurde festgestellt, dass diese Zellen einen großen Einfluss auf Th1-assoziierte entzündliche Hautkrankheiten haben. Es wurde vermutet, dass Perforin eine Rolle bei der Alloimmunität spielt, da es sowohl am zytolytischen Prozess der Abstoßung als auch an der Herunterregulierung der T-Zell-vermittelten Reaktionen im Zusammenhang mit der Alloimmunreaktion beteiligt ist. Die Perforin-vermittelte Zytotoxizität wurde auch mit einer Reihe von Autoimmunkrankheiten in Verbindung gebracht. Defekte im Perforin-Gen verursachen die familiäre hämophagozytische Lymphohistiozytose Typ 2 (HPLH2), eine seltene und tödliche autosomal-rezessive Erkrankung im frühen Kindesalter.