Sarkom-Diagnose in einer einzigen Reaktion

Der SarcomaFusion-Test weist Fusions-Transkripte in Sarkomen nach. Diese Transkripte, die mit spezifischen Subtypen und gezielten Behandlungen in Verbindung gebracht werden, sind für die Patientenversorgung von entscheidender Bedeutung. Mit Hilfe der patentierten ligationsabhängigen PCR-Technologie vereinfacht der Test die Diagnostik und verbessert unser Verständnis der Sarkom-Biologie. Sein schnelles Protokoll und seine Robustheit machen ihn zu einem wertvollen Instrument in der Onkologie.

 

 

Fusions-Transkripte werden häufig bei etwa 1/3 der Weichteiltumoren beobachtet, und in der wissenschaftlichen Literatur werden mehr als 140 verschiedene Fusionen beschrieben.

Diese Fusionen werden häufig mit bestimmten histologischen Subtypen und gezielten Therapien in Verbindung gebracht, was sie zu äußerst nützlichen molekularen Diagnosemarkern macht.

Der genaue Nachweis dieser Fusions-Transkripte ist von entscheidender Bedeutung für die optimale Behandlung von Sarkom-Patienten.

In diesem Zusammenhang bietet der von Genexpath entwickelte SarcomaFusion-Test eine kostengünstige und effiziente Lösung zum Nachweis der für diese Sarkome verantwortlichen Fusions-Transkripte. Mit diesem Ansatz können sarkomspezifische Fusionstranskripte in einer einzigen umfassenden Analyse nachgewiesen und bewertet werden, was den diagnostischen Prozess vereinfacht und ein besseres Verständnis der molekularen Natur von Sarkomtumoren ermöglicht.

 

 

 

 

 

Der GENEXPATH SarcomaFusion-Test basiert auf einer ligationsabhängigen RT-PCR-Methode (LD-RTPCR). Mit dieser semiquantitativen Technik können gleichzeitig die Expressionsniveaus einer großen Anzahl genetischer Marker und, spezifischer für diesen Test, chromosomaler Translokationen unter Verwendung von Oligonukleotid-Sondenpaaren, die für jeden dieser Marker spezifisch sind, bewertet werden.

 

Ein schnelles und einfaches Protokoll 

Aus einem RNA-Gesamtextrakt lassen sich in vier Schritten die Bibliotheken gewinnen. Ein Schritt der reversen Transkription. Ein Schritt zur Hybridisierung von Oligonukleotid-Sonden. Ein Ligationsschritt. Ein PCR-Amplifikationsschritt, gefolgt von der Sequenzierung der Bibliotheken. Es ist keine vorherige Aufreinigung erforderlich, was den Materialverlust begrenzt und eine hohe Empfindlichkeit gewährleistet. Sonden, die auf kurze genetische Sequenzen (40-60 Basen) abzielen und somit robust gegenüber RNA-Abbau sind. Geeignet für schwierige Proben wie in Paraffin eingebettete Gewebebiopsien. Nur etwa 105 Sequenzen pro Probe erforderlich, um ein analysierbares Expressionsprofil zu erhalten. GENEXPATH SarcomaFusion Bibliotheken können mit anderen Sequenzierbibliotheken geladen werden, um die Kosten zu optimieren.