El gen PTEN se identificó como un supresor tumoral que está mutado en un gran número de cánceres con alta frecuencia. La proteína codificada por este gen es una fosfatidilinositol-3,4,5-trisfosfato 3-fosfatasa. Contiene un dominio similar a la tensina, así como un dominio catalítico similar al de las proteínas tirosina fosfatasas de doble especificidad. A diferencia de la mayoría de las proteínas tirosina fosfatasas, esta proteína desfosforila preferentemente sustratos fosfoinositidos. Regula negativamente los niveles intracelulares de fosfatidilinositol-3,4,5-trisfosfato en las células y funciona como supresor tumoral al regular negativamente la vía de señalización AKT/PKB. El uso de un sitio de iniciación ascendente no canónico (CUG) produce una isoforma más larga que inicia la traducción con una leucina, y se cree que se asocia preferentemente con la membrana interna mitocondrial. Esta isoforma más larga puede contribuir a regular el metabolismo energético en las mitocondrias. En el cromosoma 9 se encuentra un pseudogén de este gen. El splicing alternativo y el uso de múltiples codones de inicio de traducción dan lugar a múltiples variantes de transcripción que codifican diferentes isoformas.