La perforina es una proteína formadora de poros con un mecanismo de formación de canales transmembrana similar a la C9, y se han demostrado homologías entre la perforina y la C9. La perforina se encuentra en los gránulos de los linfocitos T citotóxicos y las células asesinas naturales, y su función es permitir que las granzimas entren en las células diana y activen la apoptosis. La expresión de perforina aumenta en los linfocitos T CD8+ activados, y se ha determinado que estas células tienen una gran influencia en las enfermedades inflamatorias de la piel asociadas a Th1. Se ha sugerido que la perforina desempeña un papel en la aloinmunidad, al estar implicada tanto en el proceso citolítico del rechazo como en la regulación a la baja de las respuestas mediadas por células T asociadas a la respuesta aloinmune. La citotoxicidad mediada por la perforina también se ha relacionado con varias enfermedades autoinmunes. Los defectos en el gen de la perforina causan la linfohistiocitosis hemofagocítica familiar tipo 2 (HPLH2), un trastorno autosómico recesivo raro y letal de la primera infancia.