El naproxeno pertenece a la clase de medicamentos antiinflamatorios no esteroides (AINEs) y, como tal, se utiliza para tratar el dolor leve a moderado, fiebre, inflamación y artralgia en ciertas condiciones crónicas. Esta clase de medicamentos antiinflamatorios tiene un efecto sobre la inflamación y el dolor al inhibir una enzima importante en estos mecanismos, la ciclooxigenasa (COX). Existen varias ciclooxigenasas, y el naproxeno no es específico para ninguna, a diferencia de los AINEs más nuevos que se dirigen específicamente a la proteína COX-2.

Aunque se desaconsejan fuertemente los AINEs durante una infección viral porque su acción inhibe ciertos mecanismos de inmunidad innata, se están realizando estudios en curso con Covid-19 para investigar el efecto de los AINEs sobre el fenómeno de la "tormenta de citoquinas" observado en los casos más severos. Los síntomas de dificultad respiratoria observados con Covid-19 causado por VCOS-COV-2 SARS pueden reducirse mediante medicamentos que combinan efectos antiinflamatorios y antivirales. Este efecto dual puede proteger simultáneamente a pacientes críticamente enfermos y reducir la carga viral, limitando así la propagación del virus.