Il deossicolato di sodio (SDC) è un derivato dei sali biliari che ha trovato ampio impiego come detergente nella solubilizzazione ed estrazione delle proteine di membrana. I sali biliari, incluso il deossicolato, sono molecole anfifiliche naturali prodotte nel fegato e immagazzinate nella cistifellea. La struttura unica del deossicolato di sodio consente l'interazione sia con le regioni idrofobiche che idrofile delle proteine di membrana, rendendolo particolarmente efficace nel mantenere la conformazione nativa di queste proteine in soluzioni acquose.

• Naturale anfifilica:

  • Il deossicolato di sodio, come altri sali biliari, possiede regioni sia idrofobiche che idrofile. Questo carattere anfifilico gli consente di interagire con il doppio strato lipidico delle membrane, nonché con l'ambiente acquoso, facilitando la solubilizzazione delle proteine di membrana.

• Struttura steroidea:

  • Strutturalmente, il deossicolato di sodio è un composto steroideo con un nucleo steroideo idrofobico e una regione polare idrofila che contiene il moiety dell'acido deossicolico. Questa struttura contribuisce alla sua capacità di formare micelle, incapsulando le regioni idrofobiche delle proteine di membrana.

• Concentrazione del detergente:

  • Il deossicolato di sodio mostra un comportamento dipendente dalla concentrazione. Sotto la sua concentrazione critica di micelle (CMC), esiste come monomeri, e sopra la CMC, forma micelle. Questa proprietà è cruciale per la sua applicazione nella solubilizzazione delle proteine di membrana.

• Proprietà denaturanti:

  • Seppur il deossicolato di sodio sia efficace nella solubilizzazione delle proteine di membrana, può anche avere effetti denaturanti a concentrazioni più elevate. Pertanto, è essenziale ottimizzare attentamente la concentrazione del detergente per bilanciare la solubilizzazione efficace con il mantenimento della struttura proteica.

Applicazioni nella ricerca delle proteine di membrana:

• Estrazione delle proteine:

  • Il deossicolato di sodio è comunemente impiegato nell'estrazione di proteine di membrana da membrane biologiche, in particolare nella preparazione di campioni proteici per applicazioni successive.

• Lisi cellulare:

  • Nei protocolli di lisi cellulare, il deossicolato di sodio viene utilizzato per rompere le membrane cellulari, liberando le proteine di membrana per analisi successive.

• Scambio di detergente:

  • Il deossicolato di sodio è adatto a procedure di scambio di detergenti, consentendo ai ricercatori di passare a detergenti più delicati per ulteriori purificazioni o studi strutturali.

• Compatibilità con tecniche successive:

  • Il deossicolato di sodio è compatibile con varie tecniche successive, tra cui elettroforesi su gel, cromatografia e spettrometria di massa, rendendolo una scelta versatile nella ricerca delle proteine di membrana.