NKX3.1 è una proteina omeodominio soppressore del tumore specifico della prostata, codificata dal gene omeobox NKX3.1 nel cromosoma 8p21. Questa proteina è aploinsufficiente ed è frequentemente downregolata durante le prime fasi della carcinogenesi nelle lesioni premaligne e nella neoplasia intraepiteliale prostatica. La perdita di eterozigosi è presente nel 60-80% dei tumori della prostata.

NKX3.1 è espresso nell'epitelio prostatico normale, prevalentemente localizzato nel nucleo. L'adenocarcinoma prostatico primario e metastatico presenta un'intensità di colorazione inferiore rispetto alla prostata normale. Si è affermato come marcatore tissutale altamente sensibile e specifico dell'adenocarcinoma prostatico.

In un contesto diagnostico differenziale, NKX3.1 è utile per differenziare il carcinoma prostatico da quello uroteliale, con una sensibilità compresa tra il 92 e il 94% e una specificità del 100%. Uno studio recente ha inoltre dimostrato l'utilità di NKX3.1 nell'identificazione dell'adenocarcinoma prostatico metastatico (sensibilità del 98%, specificità del 99%). Combinati in un pannello con PSA e PSAP, tutti gli adenocarcinomi prostatici metastatici sono risultati positivi per almeno un marcatore.