La proteina 4 associata ai linfociti T citotossici (CTLA-4) è un recettore sulle cellule T Helper che funziona come checkpoint immunitario e downregolatore delle risposte immunitarie. Mutazioni nella CTLA-4 sono associate al diabete mellito insulino-dipendente, alla tiroidite di Hashimoto, alla malattia di Graves, al lupus eritematoso sistemico (LES), alla celiachia, alla cirrosi biliare primaria, all'orbitopatia associata alla tiroide, alla sclerosi multipla e ad altre malattie autoimmuni. La variante spliced di CTLA-4 nel LES è presente nel siero del paziente. L'aploinsufficienza di CTLA-4 causa un disturbo del sistema immunitario noto come deficit di CTLA-4 o malattia CHAI (aploinsufficienza di CTLA4 con infiltrazione autoimmune).

CTLA-4 e CD28, insieme ai loro ligandi B7-1 e B7-2, costituiscono una delle vie costimolatorie dominanti che regolano le risposte delle cellule T e B. CTLA-4 e CD28 sono molecole strutturalmente omologhe che appartengono alla superfamiglia dei geni delle immunoglobuline (Ig). Sia il CTLA-4 che il CD28 sono composti da un singolo dominio extracellulare simile alle Ig V, un dominio transmembrana e un dominio intracellulare .