È stato dimostrato che la CK5/6 si esprime nella maggior parte dei carcinomi a cellule squamose, a cellule basali, nei timomi, nei tumori delle ghiandole salivari e nel mesotelioma. Raramente reagisce con gli adenocarcinomi polmonari. L'anti-citocheratina 5 e 6 è un marcatore immunoistochimico utile per l'identificazione del mesotelioma e del carcinoma polmonare a cellule squamose. La rilevazione della citocheratina 5 nelle cellule mioepiteliali può essere utilizzata anche per aiutare a determinare i tumori maligni della mammella e della prostata.