La famiglia dei fattori di trascrizione della microftalmia/transcription factor E (MITF-TFE) comprende quattro membri della famiglia: MITF, TFE3, TFEB e TFEC. La proteina TEF3 interagisce con regolatori di trascrizione come E2F3, SMAD3 e LEF-1 ed è coinvolta nella trascrizione indotta da TGF-beta, svolgendo ruoli importanti nella crescita cellulare, nella proliferazione e nella differenziazione di osteoclasti e macrofagi. La proteina TFE3 attiva anche il gene IRS-2 epatico e induce l'esochinasi II (HK2) e il gene 1 indotto dall'insulina (INSIG1); partecipa alla segnalazione dell'insulina e potrebbe essere un bersaglio terapeutico per il diabete. La colorazione anti-TFE3 è l'indicatore più sensibile e specifico dei carcinomi a cellule renali con traslocazione Xp11. Poiché il sarcoma alveolare delle parti molli (ASPS) è caratterizzato da uno specifico riarrangiamento cromosomico che determina un fattore di trascrizione chimerico (ASPSCR1-TFE3).