Sequenziamento delle proteine anticorpali
Conoscere la sequenza del vostro anticorpo monoclonale non è solo il primo passo verso l'ingegnerizzazione dell'anticorpo e l'ottimizzazione della sua funzione, ma è anche fondamentale per la richiesta di brevetto.
L'utente fornisce:
Campione di anticorpo monoclonale (>0,2 mg, >95% puro)
Consegniamo:
- Sequenza completa delle catene pesanti e leggere
- Copertura completa della sequenza mediante LC-MS/MS
- Rapporto completo
- Dati LC-MS/MS grezzi
Vantaggi principali
- La capacità di ricostruire l'ibridoma dal campione di anticorpo monoclonale
- Determinazione accurata delle regioni CDR
- Analisi complete per confermare il prodotto anticorpale, compresa la sequenza primaria, i PTM, la glicosilazione e la varianza di sequenza.
Panoramica del servizio
Offriamo un servizio di sequenziamento de novo degli anticorpi. Sequenziamo direttamente la proteina dell'anticorpo utilizzando una digestione enzimatica multipla e una LC-MS/MS ad alta risoluzione. Il nostro servizio garantisce il sequenziamento completo delle catene pesanti e leggere.
Il nostro processo di sequenziamento non richiede informazioni su ibridomi, mRNA o altre sequenze. Fornisce una visione diretta e indipendente del vostro campione di anticorpi.
Accurato– Garantiamo una copertura di almeno 5 volte delle CDR nelle regioni variabili. Ogni amminoacido nelle CDR è supportato con sicurezza da ioni frammento in almeno cinque scansioni MS2. Per i Leu e gli Ile isomerici, ci sforziamo di fare una corretta inferenza dalla specificità dell'enzima e dalle statistiche del database degli anticorpi.
Completo – Come opzione, offriamo una caratterizzazione completa della proteina anticorpale. Il nostro servizio comprende l'analisi dei PTM, della glicosilazione, dei ponti disolfuro, dei contaminanti e di altri aspetti personalizzati in base alle vostre esigenze.
Efficiente – Utilizziamo una quantità minima di campione di anticorpi (0,2 mg) e forniamo risultati entro 15 giorni lavorativi con una qualità costante.
Metodo
La nostra procedura standard consiste nelle seguenti fasi.
- Digerire la proteina dell'anticorpo in peptidi sovrapposti con più enzimi.
- Analizzare le digestioni con LC-MS/MS utilizzando uno spettrometro di massa Thermo Orbitrap.
- Caratterizzazione dei peptidi sovrapposti con sequenziamento de novo dei peptidi.
- Assemblaggio automatico della sequenza anticorpale a partire dai peptidi caratterizzati.
- Esame e annotazione dei risultati da parte dei nostri scienziati.
