Produits pour la quantification de banques NGS
La quantification précise du nombre de molécules d'une banque est l'étape la plus critique parmi les étapes de préparation pour le séquençage nouvelle génération (NGS) pour obtenir des données de lecture de haute qualité. En effet, pour obtenir des données de lecture fiables et de qualité, il est nécessaire d'utiliser une quantité suffisante d'ADN, et en particulier pour le séquençage Illumina®. L'utilisation d'une quantité insuffisante d'ADN entraînera un rendement de séquençage faible et la surabondance d'ADN augmentera la densité du cluster et aboutira à des données de mauvaise qualité.
Les méthodes standard de quantification de banques pour le NGS, telles que celles basées sur l'électrophorèse ou la spectrophotométrie, ont une faible sensibilité, ne sont pas spécifiques de l'ADN lié à l'adaptateur, et nécessitent généralement une grande quantité d'échantillon de banques pour l'analyse. La PCR quantitative est considérée comme la méthode la plus précise et efficace de quantification de banque, fournissant une consistance et une reproductibilité considérablement plus élevée que l'électrophorèse ou la spectrophotométrie, qui mesurent la concentration totale d'acide nucléique. Les méthodes basées sur l'amplification ne quantifient que les molécules qui contiennent les deux séquences d'adaptateurs, fournissant ainsi une estimation plus précise de la concentration des molécules de la banque qui peuvent être séquencées.
