Séquençage nouvelle génération (NGS)
Le séquençage nouvelle génération (NGS), également connu sous le nom de séquençage à haut débit, est un terme commun utilisé pour décrire différentes technologies de séquençage moderne comme :
- Illumina® (Solexa)
- Roche 454
- Ion torrent: Proton / PGM
- SOLiD
Ces technologies récentes permettent de séquencer l'ADN et l'ARN beaucoup plus rapidement que les méthodes précédentes comme le séquençage de Sanger, et comme tels ont révolutionné l'étude de la génomique et de la biologie moléculaire
Les technologies NGS présentent 3 étapes communes :
- La préparation de banques : les banques sont créées en utilisant une fragmentation aléatoire de l'ADN suivie de la liaison avec des petites séquences spécifiques
- L'amplification : la banque est amplifiée grâce à des méthodes d'amplification clonale et de PCR
- Le séquençage : l'ADN est séquencé en utilisant différentes approches en fonction de la technologie utilisée
La technologie NGS la plus utilisée est la technologie Illumina®. Cette technologie utilise l'amplification clonale et la séquençage par synthèse (SBS). Le processus permet d'identifier simultanément les bases d'ADN lorsqu'elles sont incorporées dans la chaîne d'acide nucléique. Chaque base émet un signal de fluorescence unique lorsqu'elle est ajoutée au brin en cours de synthèse, ceci est utilisé pour déterminer la séquence d'ADN.
La technologie NGS peut être utilisée pour séquencer l'ADN de n'importe quel organisme, fournissant des informations précieuses en réponse à presque n'importe quelle question biologique. En tant que technologie hautement évolutive, le séquençage de l'ADN peut être appliqué à de petites régions ciblées ou à l'ensemble du génome grâce à une variété de méthodes.
