La perforine est une protéine formant des pores avec un mécanisme de formation du canal transmembranaire similaire à celui de C9 et une homologie entre la perforine et C9 a été démontrée. La perforine se trouve dans les granules de lymphocytes T cytotoxiques et de cellules tueuses naturelles, ce qui permet aux granzymes de pénétrer dans les cellules cibles et d'activer l'apoptose. L'expression de la perforine est régulée positivement dans les cellules T CD8 + activées, et ces cellules ont été identifiées comme ayant une influence majeure sur les maladies inflammatoires de la peau associées au Th1. Il a été suggéré que la perforine joue un rôle dans l'allo-immunité, étant impliquée à la fois dans le processus de rejet cytolytique et dans la régulation négative des réponses à médiation par les cellules T associées à la réponse allo-immune. La cytotoxicité à médiation par la perforine a également été liée à un certain nombre de maladies auto-immunes. Des anomalies du gène de la perforine sont à l'origine d'une lymphohistiocytose hémophagocytaire familiale de type 2 (HPLH2), une maladie autosomique récessive rare et mortelle chez le jeune enfant.