Le carcinome de la ligne médiane du NUT (CMN) est une forme rare et agressive de carcinome épidermoïde qui apparaît principalement dans la tête, le cou ou le médiastin. Le CMN est génétiquement défini par la présence de réarrangements chromosomiques impliquant le gène NUTM1. Les deux tiers des CMN ont une translocation t(15;19) (q14;p13.1) fusionnant le gène NUTM1 au gène BRD4. Moins fréquemment, les CMN abritent un gène de fusion de la variante NUTM1 impliquant le gène BRD3 ou des gènes encore non caractérisés. Les CMN peuvent être impossibles à distinguer des carcinomes épidermoïdes plus courants et constituent donc une entité sous-diagnostiquée. Par conséquent, le diagnostic des CMN dépend de la confirmation du réarrangement des NUTM1. BRD3 et BRD4 appartiennent à la famille des protéines bromo et extra-terminales (BET) des bromodomaines. Les oncoprotéines chimériques BRD-NUTM1 répriment la différenciation malpighienne, éventuellement en séquestrant l'activité de l'histone acétyltransférase. En conséquence, il a été démontré que les inhibiteurs d'histone désacétylases ou les inhibiteurs BET inversent les effets des protéines de fusion BRD-NUTM1 en induisant la différenciation terminale des cellules CMN in vitro et dans des modèles de xénogreffes. Par conséquent, la détection des réarrangements de NUTM1 par FISH représente un outil utile dans le diagnostic différentiel des CMN et peut avoir une signification thérapeutique.