TransGen Biotech

La première étape d’un séquençage nouvelle génération (NGS) est la préparation d'une banque d'ADN. Et pour que ce séquençage NGS soit réussi il faut que la banque d’ADN soit de haute qualité. Cependant tous les échantillons ne permettent pas d’obtenir un ADN de bonne qualité pour obtenir une banque d’ADN de qualité. On parle alors d’échantillons difficiles. Il s’agit entre autres d’échantillons FFPE, d’échantillons d’ADN sans cellule ou encore de très petits échantillons (également appelé cellule unique ou single cell). Bien que ces échantillons délivrent de l’ADN de mauvaise qualité et/ou en très petite quantité, leur analyse permet d’obtenir des résultats qui ne sont pas possibles avec d’autres échantillons. Il s’agit par exemple, de l’ADN tumoral circulant ou encore de biopsies de tumeurs. Lorsque l'on commence avec de l'ADN en quantité limitée ou de qualité variable, la méthode de préparation de la banque doit être précise et efficace, en évitant les étapes de purification qui réduisent la récupération de l'échantillon.