Le désoxycholate de sodium (SDC) est un dérivé des sels biliaires qui a trouvé une large application comme détergent dans la solubilisation et l'extraction des protéines membranaires. Les sels biliaires, dont le désoxycholate, sont des molécules amphiphiles naturelles produites par le foie et stockées dans la vésicule biliaire. La structure unique du désoxycholate de sodium lui permet d'interagir avec les régions hydrophobes et hydrophiles des protéines membranaires, ce qui le rend particulièrement efficace pour maintenir la conformation native de ces protéines dans les solutions aqueuses.

• Nature amphiphile :

Le désoxycholate de sodium, comme les autres sels biliaires, possède des régions hydrophobes et hydrophiles. Ce caractère amphiphile lui permet d'interagir avec la bicouche lipidique des membranes ainsi qu'avec l'environnement aqueux, facilitant ainsi la solubilisation des protéines membranaires.

• Structure stéroïdienne :

Structurellement, le désoxycholate de sodium est un composé stéroïdien avec un noyau stéroïdien hydrophobe et une région polaire hydrophile contenant la fraction d'acide désoxycholique. Cette structure contribue à sa capacité à former des micelles, encapsulant les régions hydrophobes des protéines membranaires.

• Concentration en détergent :

Le désoxycholate de sodium présente un comportement dépendant de la concentration. En dessous de sa concentration critique en micelles (CMC), il existe sous forme de monomères, et au-dessus de la CMC, il forme des micelles. Cette propriété est cruciale pour son utilisation dans la solubilisation des protéines membranaires.

• Propriétés de dénaturation :

Bien que le désoxycholate de sodium soit efficace pour solubiliser les protéines membranaires, il peut également avoir des effets dénaturants à des concentrations plus élevées. Par conséquent, il est essentiel d'optimiser soigneusement la concentration du détergent afin d'équilibrer une solubilisation efficace et la préservation de la structure des protéines.

Applications dans la recherche sur les protéines membranaires :

• Extraction des protéines :

Le désoxycholate de sodium est couramment utilisé pour l'extraction des protéines membranaires des membranes biologiques, en particulier pour la préparation d'échantillons de protéines pour des applications en aval.

• Lyse cellulaire :

Dans les protocoles de lyse cellulaire, le désoxycholate de sodium est utilisé pour perturber les membranes cellulaires, libérant ainsi les protéines membranaires en vue d'une analyse ultérieure.

• Échange de détergents :

Le désoxycholate de sodium se prête aux procédures d'échange de détergents, ce qui permet aux chercheurs de passer à des détergents plus doux pour poursuivre la purification des protéines ou les études structurales.
Compatibilité avec les techniques en aval :

Le désoxycholate de sodium est compatible avec diverses techniques en aval, notamment l'électrophorèse sur gel, la chromatographie et la spectrométrie de masse, ce qui en fait un choix polyvalent pour la recherche sur les protéines membranaires.