Les protéases des coronavirus, comme le SARS-CoV-2, la protéase de type papaïne (PLpro pour papain-like protease) et la protéase de type 3C (3CLpro pour 3C-like protease), sont des cibles antivirales intéressantes car elles sont essentielles à la réplication des coronavirus. La PLPro est une protéase localisé dans la protéine non structurale 3 (NS3) du polypeptide viral. La PLpro a la fonction supplémentaire de retirer l'ubiquitine et l'ISG15 des protéines des cellules hôtes pour aider les coronavirus à échapper aux réponses immunitaires innées de l'hôte. En effet, l’action de la PLPro perturbe les voies de signalisation de l’INF beta et de NF-kappa B. Le ciblage de la protéase de type papaïne avec des médicaments antiviraux peut avoir un avantage non seulement en inhibant la réplication virale, mais aussi en inhibant le dérèglement des cascades de signalisation dans les cellules infectées qui peuvent conduire à la mort cellulaire dans les cellules environnantes non infectées.