Cytokeratine 5 (58 kDa) is een basisch type cytokeratine met een hoog molecuulgewicht dat tot expressie komt in de basale, intermediaire en oppervlakkige cellagen van gelaagde epithelia, alsmede in overgangsepithelia, complexe epithelia en in mesotheliale cellen en mesothelioom. Cytokeratine 6 (56 kDa) is ook een cytokeratine met een hoog molecuulgewicht van het basistype, dat tot expressie komt in prolifererend plaveiselepitheel, vaak in combinatie met cytokeratine 16.

CK5/6 blijkt tot expressie te komen in de overgrote meerderheid van plaveiselcelcarcinomen, basaalcelcarcinomen, thymomen, speekselkliertumoren en mesothelioom. Het reageert zelden op longadenocarcinomen. Anti-Cytokeratine 5 & 6 is een nuttige immunohistochemische marker bij de identificatie van mesothelioom en plaveiselcelcarcinoom in de longen. De detectie van cytokeratine 5 in myoepitheelcellen kan ook worden gebruikt als hulpmiddel bij het vaststellen van borst- en prostaatmaligniteiten.