Perforine is een porievormend eiwit met een mechanisme van transmembraankanaalvorming dat lijkt op C9, en er is homologie aangetoond tussen perforine en C9. Perforine wordt aangetroffen in de granules van cytotoxische T-lymfocyten en natural killer cellen, en functioneert om granzzymen in staat te stellen de doelcellen binnen te dringen en apoptose te activeren. De expressie van perforine is verhoogd in geactiveerde CD8+ T-cellen, en er is vastgesteld dat deze cellen een grote invloed hebben op Th1-geassocieerde inflammatoire huidziekten. Er is gesuggereerd dat perforine een rol speelt bij alloimmuniteit, omdat het betrokken is bij zowel het cytolytische proces van afstoting als bij de downregulatie van de T-cel gemedieerde reacties die gepaard gaan met de alloimmuunrespons. Perforin-gemedieerde cytotoxiciteit is ook in verband gebracht met een aantal auto-immuunziekten. Defecten in het perforine-gen veroorzaken familiaire hemofagocytische lymfohistiocytose type 2 (HPLH2), een zeldzame en dodelijke autosomaal recessieve aandoening op jonge leeftijd.