Monster worden geliseerd en door de membraan geleid met behulp van centrifugale of vacuümkracht. Was- en elutiesolutions worden vervolgens door de membraan geleid, en het monster wordt verzameld in een buis door centrifugatie of vacuüm.

Vaste-fase-extractie, zoals het gebruik van een spin-kolomgebaseerde extractiemethode, maakt gebruik van het feit dat DNA aan silica bindt. Het monster dat DNA bevat, wordt toegevoegd aan een kolom die silica-gel of silicabeads en chaotrope zouten bevat. De chaotrope zouten verstoren de waterstofbinding tussen de strengen en vergemakkelijken de binding van DNA aan silica door de nucleïnezuur hydrofobe te maken. Dit maakt de fosfaatresten bloot, zodat ze beschikbaar zijn voor adsorptie. Het DNA bindt aan de silica, terwijl de rest van de oplossing wordt gewassen met ethanol om chaotrope zouten en andere onnodige componenten te verwijderen. Het DNA kan vervolgens worden gehydrateerd met aqueous oplossingen met een laag zoutgehalte, waardoor elutie van het DNA uit de beads mogelijk wordt.