De alcianblauwe vlek wordt gebruikt om zuur slijm en azijnhoudende mucinen te kleuren.

Bij mesothelioom worden overmatige hoeveelheden niet-gesulfateerd zuur slijm waargenomen. Dit slijm is in normale hoeveelheden aanwezig in de wanden van de bloedvaten, maar neemt toe in vroege laesies van atherosclerose.

De pH van de Alcian blauw kleuring oplossing is zeer belangrijk en heeft een direct effect op de categorie van mucines die door deze methode worden onthuld. De pH van de Alcian blauw kleuroplossing kan tussen 0,4 en 2,5 liggen.

Als de pH van de oplossing 1,0 is, zal de oplossing de gesulfateerde zure mucinen bevlekken. Deze mucinen worden vooral aangetroffen in het kraakbeen, de gobletcellen van de dikke darm en de bronchiale sereuze cellen.
Bij een pH van 2,5 van de Alcian blauw kleuring zijn het de gecarboxyleerde mucinen in het bindweefsel en het kraakbeen die worden gekleurd.