Compensatieparels zijn cruciale componenten in de flowcytometrie. Naarmate de flowcytometrie zich verder ontwikkelt om steeds complexere experimenten met meerdere fluorescerende markers mogelijk te maken, wordt de behoefte aan nauwkeurige compensatie voor spectrale overlappen steeds belangrijker.

In de flowcytometrie worden vaak meerdere fluorescerende kleurstoffen tegelijkertijd gebruikt om verschillende cellulaire markers te labelen. Veel fluoroforen hebben echter overlappende emissiespectra, wat kan leiden tot fluorescentie spillover. Dit fenomeen doet zich voor wanneer het signaal van een fluorochroom het signaal van een ander verontreinigt, wat resulteert in een onnauwkeurige gegevensinterpretatie.

Compensatieparels zijn speciaal ontworpen deeltjes die onderzoekers helpen hun flowcytometers te kalibreren om deze spectrale overlappen te corrigeren. Ze zijn meestal gemaakt van polystyreen en bedekt met antilichamen die specifiek zijn voor bepaalde markers, en deze parels kunnen worden gemerkt met verschillende fluorochromen. Wanneer ze op een gecontroleerde manier worden gemengd met fluorochroom-geconjugeerde antilichamen, creëren ze verschillende populaties die het gedrag van echte cellen nabootsen. Het primaire doel van deze parels is het instellen van de compensatie-instellingen op de flowcytometer. Door monsters van compensatieparels samen met experimentele monsters uit te voeren, kunnen onderzoekers de mate van spillover tussen verschillende kanalen bepalen. Dit maakt het mogelijk om nauwkeurige aanpassingen in de instrumentinstellingen te maken, zodat elk fluorescerend signaal correct wordt toegewezen aan de bijbehorende marker.