Natriumdeoxycholaat (SDC) is een galzoutafgeleide die veel wordt toegepast als detergent bij de solubilisatie en extractie van membraaneiwitten. Galzouten, waaronder deoxycholaat, zijn natuurlijke amphifiele moleculen die in de lever worden geproduceerd en in de galblaas worden opgeslagen. De unieke structuur van natriumdeoxycholaat maakt het mogelijk om zowel met de hydrofobe als hydrofiele regio's van membraaneiwitten te interageren, waardoor het bijzonder effectief is in het behouden van de native conformatie van deze eiwitten in aquatische oplossingen.

• Amphifiele natuur:

  • Natriumdeoxycholaat, net als andere galzouten, heeft zowel hydrofobe als hydrofiele regio's. Dit amphifiele karakter stelt het in staat om te interageren met de lipidenbilaag van membranen en de aquatische omgeving, waardoor de solubilisatie van membraaneiwitten wordt vergemakkelijkt.

• Steroïde structuur:

  • Strikt genomen is natriumdeoxycholaat een steroïdverbinding met een hydrofobe steroïdkern en een hydrofiele polaire regio die het deoxycholzuur-moiety bevat. Deze structuur draagt bij aan het vermogen om micellen te vormen, waarin hydrofobe gebieden van membraaneiwitten worden ingekapseld.

• Detergentconcentratie:

  • Natriumdeoxycholaat vertoont concentratie-afhankelijk gedrag. Onder zijn kritische micelconcentratie (CMC) bestaat het uit monomeren, en boven de CMC vormt het micellen. Dit is essentieel voor de solubilisatie van membraaneiwitten.

• Denaturatie-eigenschappen:

  • Hoewel natriumdeoxycholaat effectief is in het solubiliseren van membraaneiwitten, kan het bij hogere concentraties denaturerende effecten hebben. Daarom is het noodzakelijk om de concentratie van het detergent zorgvuldig te optimaliseren om een effectieve solubilisatie te combineren met de instandhouding van de eiwitstructuur.

Toepassingen in membraaneiwitonderzoek:

• Extractie van eiwitten:

  • Natriumdeoxycholaat wordt vaak gebruikt bij de extractie van membraaneiwitten uit biologische membranen, met name bij de voorbereiding van eiwitmonsters voor verdere toepassingen.

• Cellysis:

  • In cellysis-protocollen wordt natriumdeoxycholaat gebruikt om cellulaire membranen te verstoren en membraaneiwitten vrij te geven voor verdere analyse.

• Detergentuitwisseling:

  • Natriumdeoxycholaat is geschikt voor detergentuitwisselingsprocedures, waarmee onderzoekers kunnen overstappen op mildere detergenten voor verdere eiwitzuivering of structurele studies.

• Compatibiliteit met downstream technieken:

  • Natriumdeoxycholaat is compatibel met verschillende downstreamtechnieken, waaronder gelelektroforese, chromatografie en massaspectrometrie, waardoor het een veelzijdige keuze is voor membraaneiwitonderzoek.