De microphthalmia transcriptiefactor/transcriptiefactor E (MITF-TFE) familie van basic helix-loop-helix leucine zipper (bHLH-Zip) transcriptiefactoren omvat vier familieleden: MITF, TFE3, TFEB en TFEC. Het TEF3-eiwit interageert met transcriptieregelaars zoals E2F3, SMAD3 en LEF-1, en is betrokken bij door TGF-beta geïnduceerde transcriptie, en speelt een belangrijke rol bij celgroei, proliferatie en differentiatie van osteoclasten en macrofagen. Het TFE3-eiwit activeert ook het lever-IRS-2-gen, en induceert hexokinase II (HK2) en insuline-geïnduceerd gen 1 (INSIG1); het neemt deel aan de insuline-signalering en zou een therapeutisch doelwit voor diabetes kunnen zijn. Anti-TFE3-kleuring is de meest gevoelige en specifieke indicator van Xp11-translocatie niercelcarcinomen. Aangezien alveolair weke delen sarcoom (ASPS) wordt gekenmerkt door een specifieke chromosoomherschikking die resulteert in een chimere transcriptiefactor (ASPSCR1-TFE3).