O carcinoma de linha média de NUT (NMC) é uma forma rara e agressiva de carcinoma de células escamosas que surge principalmente na cabeça, pescoço ou mediastino. O NMC é geneticamente definido pela presença de rearranjos cromossômicos envolvendo o gene NUTM1. Dois terços dos NMCs apresentam a translocação t(15;19) (q14;p13.1), fundindo o gene NUTM1 com o gene BRD4. Menos comumente, o NMC possui um gene de fusão variante de NUTM1 envolvendo o BRD3 ou genes ainda não caracterizados. Os NMCs podem ser indistinguíveis de carcinomas de células escamosas mais comuns e, portanto, são uma entidade subdiagnosticada. Portanto, o diagnóstico de NMC depende da confirmação do rearranjo de NUTM1. BRD3 e BRD4 pertencem à família de proteínas bromodomínio Bromo e Extra Terminal (BET). As oncoproteínas quiméricas BRD-NUTM1 reprimem a diferenciação escamosa, possivelmente ao sequestrar a atividade da histona acetiltransferase. Consequentemente, demonstrou-se que inibidores da desacetilase de histona ou inibidores BET revertem os efeitos das proteínas de fusão BRD-NUTM1, induzindo a diferenciação terminal das células NMC in vitro e em modelos xenotransplantados. Portanto, a detecção de rearranjos de NUTM1 por FISH representa uma ferramenta útil no diagnóstico diferencial de NMC e pode ter significado terapêutico.