O naproxeno pertence à classe de anti-inflamatórios não esteroides (AINEs) e, como tal, é utilizado para tratar dor leve a moderada, febre, inflamação e artralgia em certas condições crônicas. Esta classe de medicamentos anti-inflamatórios tem efeito sobre a inflamação e a dor, inibindo uma enzima importante nesses mecanismos, a ciclooxigenase (COX). Existem várias ciclooxigenases e o naproxeno não é específico para nenhuma, ao contrário dos AINEs mais novos que visam especificamente a proteína COX-2.

Embora os AINEs sejam fortemente desaconselhados durante uma infecção viral porque sua ação inibe certos mecanismos da imunidade inata, estudos em andamento com Covid-19 estão investigando o efeito dos AINEs no fenômeno da "tempestade de citocinas" observado nos casos mais graves. Os sintomas de dificuldade respiratória observados com Covid-19 causados pelo VCOS-COV-2 SARS podem ser reduzidos por medicamentos que combinam efeitos anti-inflamatórios e antivirais. Esse efeito duplo pode proteger simultaneamente pacientes criticamente enfermos e reduzir a carga viral, limitando assim a propagação do vírus.