Diagnóstico de Sarcoma numa única reação

 Diagnóstico de Sarcoma numa única reação

O teste SarcomaFusion detecta transcrições de fusão em sarcomas. Estas transcrições, associadas a subtipos específicos e a tratamentos direccionados, são cruciais para o tratamento dos doentes. Utilizando a tecnologia patenteada de PCR dependente de ligação, o teste simplifica o diagnóstico e melhora a nossa compreensão da biologia do sarcoma. O seu protocolo rápido e a sua robustez tornam-no uma ferramenta valiosa em oncologia.

 

 Teste de fusão de sarcoma

Um teste único, baseado numa tecnologia patenteada de PCR dependente de ligação

 

Os transcritos de fusão são frequentemente observados em cerca de 1/3 dos tumores de tecidos moles e a literatura científica descreve mais de 140 fusões diferentes.

Estas fusões estão frequentemente associadas a subtipos histológicos específicos e a terapias direccionadas, o que as torna marcadores de diagnóstico molecular extremamente úteis.

A deteção exacta destas transcrições de fusão é de importância vital para uma gestão óptima dos doentes com sarcomas.

Neste contexto, o teste SarcomaFusion, desenvolvido pela Genexpath, oferece uma solução económica e eficaz para detetar os transcritos de fusão responsáveis por estes sarcomas. Com esta abordagem, os transcritos de fusão específicos dos sarcomas podem ser detectados e avaliados numa única análise exaustiva, simplificando o processo de diagnóstico e proporcionando uma melhor compreensão da natureza molecular dos tumores sarcomatosos.

 

 

 

 
 

Utilização do teste

 
O teste GENEXPATH SarcomaFusion baseia-se num método de RT-PCR dependente de ligação (LD-RTPCR). Esta técnica semi-quantitativa pode ser utilizada para avaliar simultaneamente os níveis de expressão de um grande número de marcadores genéticos e, mais especificamente para este teste, de translocações cromossómicas, utilizando pares de sondas de oligonucleótidos específicos para cada um destes marcadores.
 

Um protocolo rápido e simples 

  • A partir de um extrato de ARN total, são suficientes quatro etapas para obter as bibliotecas.
  • Uma etapa de transcrição reversa.
  • Uma etapa de hibridação de sondas de oligonucleótidos.
  • Uma etapa de ligação.
  • Uma etapa de amplificação por PCR, seguida da sequenciação das bibliotecas.
  • Não é necessária purificação prévia, o que limita a perda de material e garante uma elevada sensibilidade.
  • Sondas que visam sequências genéticas curtas (40-60 bases), oferecendo robustez contra a degradação do ARN.
  • Adequado para amostras difíceis, como biópsias de tecidos incluídos em parafina.
  • São necessárias apenas cerca de 105 sequências por amostra para obter um perfil de expressão analisável.
  • As bibliotecas GENEXPATH SarcomaFusion podem ser carregadas com outras bibliotecas de sequenciação para otimizar os custos.

 

 

 

Análise informática precisa utilizando software específico

Uma vez concluída a sequenciação, o ficheiro FASTQ pode ser carregado para a plataforma RT-MIS. Em apenas alguns minutos de análise, o RT-MIS gera um ficheiro com os transcritos de fusão detectados. O RT-MIS fornece igualmente uma bibliografia associada às transcrições detectadas, oferecendo aos investigadores do cancro uma solução completa.

 

Duração do manuseamento 5hrs30’
Tempo de trabalho efetivo 1hr-1hr30’
Tipo de ácido nucleico RNA
Quantidade de entrada Entre 50 e 500ng de ARN num volume de 2μl
Tipo de cancro     Sarcoma
Conteúdo do kit de reagentes Sondas que visam mais de 140 transcrições de fusão, códigos de barras, iniciadores de sequência
Método RT-PCR dependente de ligação
Descrição Detecta mais de 140 transcrições de fusão associadas ao sarcoma numa única análise.
Compatibilidade do equipamento MiSeq, NextSeq 500, NextSeq 550 Illumina®
Tipo de amostras Biópsias de tecido fixadas e incluídas em parafina
Tecnologia Sequenciação de nova geração

 

O RT-MIS é, portanto, simples, rápido e seguro para o utilizador.

 

Agora, pode comprar o Kit que corresponde às suas necessidades e ter a certeza de obter os melhores resultados num curto espaço de tempo 

 

Produtos  Tamanho Gato#
SarcomaFusão

  Teste 
8 reacções

GEP-SF8

 16 reacções

GEP-SF16 

 24 reacções

GEP-SF24 

48 reacções

GEP-SF48

 

 

Para mais informações :

 

Consultar a publicação de referência Kit SarcomaFusion